В гербарии хранятся ценнейшие 53 выпуска «Herbarium Florae Rossicae a Museo Botanico Academiae Imperialis ScintiarumPetropolitanae editum», принадлежавшие И. И. Шираевскому и приобретенные кафедрой в 1916 г. Кроме того, имеются по четыре выпуска «Bryotheca Rossica. Edidit Hortus Botanicus Principalis Reip. Rossicae» и «Lichenotheca Rossica. Edidit Hortus Botanicus Reipublicae Rossicae».

С целью облегчения и ускорения процесса поисковой работы разработана, заполняется и постоянно усовершенствуется компьютерная база данных Access, что позволяет хранить и использовать информацию гербарных этикеток в электронной форме.

С коллекциями гербария работали учёные многих вузов и научных учреждений из Москвы, Санкт-Петербурга, Астрахани, Волгограда, Липецка, Владивостока и других городов России, а также из университета Флориды (США). С использованием фондов гербария выпущены значимые сводки по флоре России («Флора Нижнего Поволжья», «Флора средней полосы европейской части России», «Зонтичные (Umbelliferae) России»). Гербарий осуществляет обмен материалами с ведущими гербариями России. Научные материалы гербария были использованы при составлении коллективных монографий: «Флора Саратовской области», двух изданий «Конспекта флоры Саратовской области», подготовке трех изданий «Красной книги Саратовской области» и более 25 статей.

Гербарий сосудистых растений смонтирован на листах форматом 28 см х 43 см, снабжен типовыми этикетками, размещен в шкафах и в коробках специальной конструкции. Он разложен по семействам в соответствии с системой Энглера. Роды внутри семейств и виды внутри родов расположены по алфавиту. Названия семейств, родов и видов указаны на специальных бирках. Гербарий мхов, лишайников и грибов хранится в специальных конвертах из крафт-бумаги, часть экземпляров смонтирована на стандартных гербарных листах, объемные образцы находятся в демонстрационных коробках.

Сотрудники Гербария активно участвуют в поисках новых возможностей использования фондов для современных научно-теоретических исследований. Делаются попытки воссоздания эволюционной истории видов. Совместно с сотрудниками географического факультета СГУ активно используются ГИС-технологии для анализа комплекса условий, в которых существуют растения. Действительность диктует иные подходы к включению видов растений в Красные книги, сотрудники гербария ведут работу по определению критериев регионального и федерального значения для растений, традиционно включаемых в Красные книги.